Prace podzielone były na kilka etapów. Część z nich odbywała się na miejscu w katedrze, gdzie odrestaurowywano elementy stałe ołtarza, zaś pozostała część rozmontowana trafiła do specjalistycznej pracowni. Po rozmontowaniu nastawy ołtarza odsłonięte zostały zachowane we fragmentach dekoracje malarskie ściany z II poł. XVI, XVII i XVIII w. Warstwy te wraz z tynkami zostały poddane badaniom i konserwacji technicznej. – Po demontażu ołtarza musieliśmy pofalowane i popękane obrazy olejne na płótnie bardzo ostrożnie odkleić od desek struktury w celu przeprowadzenia ich konserwacji technicznej. Usunęliśmy werniksy i przemalowania z XX w. Ubytki płótna zostały uzupełnione wklejonymi protezami. Odczyszczona, zdezynfekowana i zaimpregnowana została powierzchnia płótna odwrocia. Następnie obrazy zostały zdublowane na nowe płótno w celu wzmocnienia ich osłabionej struktury. Uzupełniono ubytki zapraw obrazów i wykonano ich scalenie kolorystyczne. Podczas badań konserwatorskich odsłonięto we fragmentach elementy pierwotnej kompozycji obrazu Matki Bożej. Można stwierdzić, że pierwotnie obraz był większego formatu i został po docięciu wtórnie użyty do dekoracji ołtarza.

Konserwacji poddano również metalowe sukienki i koronę z obrazu Chrystusa Boleściwego oraz korony, gwiazdy i półksiężyc z obrazu Matki Bożej. Z warstw pierwotnych pobrane zostały do badań próbki farb w celu próby datowania wcześniejszej kompozycji. Rzeźby ołtarzowe pierwotnie malowane ciemniejącą z czasem bielą ołowiową zostały w latach 70. XX w. przemalowane laserunkowo w kolorze ciepłej bieli. Warstwa ta, przykrywająca skorodowaną, częściowo jedynie zachowaną, poszarzałą biel ołowiową, została po odczyszczeniu i scaleniu kolorystycznym pozostawiona - wyjaśnił Marcin Gruszczyński, prowadzący prace konserwatorskie.

W sesji podsumowującej prace związane z renowacją ołtarza wzięli udział przedstawiciele lokalnych władz, kapłani, seminarzyści oraz mieszkańcy miasta.